經(jīng)過(guò)20世紀(jì)80年代海運(yùn)體制的改革和國(guó)際海運(yùn)市場(chǎng)的開(kāi)放，在海運(yùn)經(jīng)濟(jì)中政府力量收縮，市場(chǎng)力量擴(kuò)大。進(jìn)入90年代以后，政府職能進(jìn)一步調(diào)整，政府作用的重點(diǎn)在于對(duì)FBA頭程海運(yùn)經(jīng)濟(jì)的宏觀調(diào)控而市場(chǎng)體系進(jìn)一步完善，市場(chǎng)對(duì)海運(yùn)經(jīng)濟(jì)初步發(fā)揮資源配置的基礎(chǔ)性作用。

關(guān)于政府的作用

在亞馬遜頭程海運(yùn)市場(chǎng)開(kāi)放十余年之后，市場(chǎng)的盲目性和滯后性逐漸凸顯，中國(guó)政府通過(guò)對(duì)運(yùn)力和港口進(jìn)行調(diào)控，降低市場(chǎng)失靈對(duì)海運(yùn)經(jīng)濟(jì)帶來(lái)的損失程度。在該時(shí)期，中國(guó)政府改變以往直接干預(yù)海運(yùn)企業(yè)微觀具體的管理和生產(chǎn)的做法，轉(zhuǎn)向“抓大放小”，僅直管數(shù)家大型企業(yè)，將工作重心轉(zhuǎn)移到全行業(yè)的管理之上，這有利于中國(guó)行業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力的增強(qiáng)，以及為國(guó)際海運(yùn)業(yè)市場(chǎng)化的順利推進(jìn)提供保障。除此之外，政府對(duì)于FBA頭程海運(yùn)市場(chǎng)的統(tǒng)一與開(kāi)放發(fā)揮不可替代的作用。

第一，在國(guó)際海運(yùn)市場(chǎng)統(tǒng)一方面。兩岸三通既是中國(guó)的重大政治事件，也是海運(yùn)事業(yè)的重大事件。

在該時(shí)期，兩岸的經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)率都很高，雙方的貿(mào)易關(guān)聯(lián)度也越來(lái)越高，潛在的國(guó)際海運(yùn)量巨大，只因政治的藩籬割裂了兩岸的航線。自1979年起，中國(guó)政府一直推進(jìn)海峽兩岸的海運(yùn)通航事業(yè)。由于臺(tái)灣當(dāng)局在FBA海運(yùn)方面仍實(shí)行“三不”政策（不接觸、不談判、不妥協(xié)），中國(guó)大陸與臺(tái)灣地區(qū)不能直接通航。在此背景下，兩岸的海運(yùn)一般通過(guò)兩種途徑解決：第一，臺(tái)灣地區(qū)與中國(guó)大陸之間的進(jìn)出口業(yè)務(wù)以三角貿(mào)易形式進(jìn)行，且必須經(jīng)由第三地港口轉(zhuǎn)運(yùn)，日本、韓國(guó)和中國(guó)香港成為中國(guó)臺(tái)灣地區(qū)與中國(guó)大陸貿(mào)易主要的中轉(zhuǎn)地；第二，中國(guó)臺(tái)灣地區(qū)和中國(guó)大陸的頭程海運(yùn)企業(yè)將船舶移籍國(guó)外成為方便旗船，交由國(guó)外公司經(jīng)營(yíng)，此類(lèi)船舶均可以停靠中國(guó)臺(tái)灣地區(qū)和中國(guó)大陸的港口。

長(zhǎng)期以來(lái)，以第一種方式為主，第二種方式較少采用，中國(guó)遠(yuǎn)洋運(yùn)輸公司曾將部分船舶交付給注冊(cè)在巴拿馬、馬耳他和塞浦路斯等方便旗大國(guó)的公司使用，由設(shè)立在中國(guó)香港的著名公司如Para-kou,TatOn和YiekFung來(lái)經(jīng)營(yíng)管理。90年代中國(guó)大陸的目標(biāo)是海峽兩岸“雙向直航”。在海峽兩岸的共同努力下，海峽兩岸定點(diǎn)直航取得了重大突破，1997年4月19日福建省廈門(mén)輪船總公司的一艘掛圣文森方便旗的輪船從廈門(mén)開(kāi)往高雄；4月24日，臺(tái)灣立榮國(guó)際海運(yùn)公司的一艘輪船從高雄駛向廈門(mén)，標(biāo)志兩岸定點(diǎn)直航雙向開(kāi)通。此次的定點(diǎn)直航僅局限于國(guó)際貿(mào)易中轉(zhuǎn)的集裝箱運(yùn)輸，在此之后中國(guó)政府堅(jiān)持不懈地破除種種限制，為實(shí)現(xiàn)兩岸無(wú)障礙直航努力。